Annexe 1 : quelques familles de molécules

Les protéines

Une protéine est  une chaîne d’acide aminés
Un acide aminé, comme son nom l’indique est constitué d’une fonction acide R-COOH et d’une fonction amine -NH. Différents acides aminés (notation AA) s’associent grâce à des liaisons dites “peptidiques”.
De quoi s’agit-il ? tout simplement d’une réaction entre la fonction acide d’un AA et la fonction amine d’un autre AA : une molécule d’eau est éliminée).

glycine_alanine

Glycine et Alanine deux des acides nucléiques constituant une molécule d’ADN

En additionnant plusieurs AA, l’arrangement spatial des atomes va être perturbé, et selon les atomes en présence, différents rapprochements (attraction de type électrostatique) vont se mettre en place : d’où l’apparition de structure en hélice (repliement local), ou en feuillets (les longues chaînes polypeptidiques se replient parallèlement côte à côte), ou sans vraiment d’organisation particulière (ce qu’on appelle “pelote statistique”).

Pour les grosses protéines, possédant quelques centaines d’AA, selon les parties concernées, on observe une structure en hélice ou en feuillet ou en pelote inorganisée. Tout cela devant cohabiter, il en résulte, que dans l’espace, la protéine a une structure tridimensionnelle qui lui est propre. Toute cette organisation à l’échelle atomique va induire les différentes propriétés physico-chimiques des protéines.

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